謄本　二女が抜けているのですが…。

除籍謄本に子供の記載（今回の場合は、長女と次女）が記載されていない理由として、分籍、養子縁組、死亡などが考えられます。子供（長女や次女）が結婚、分籍、死亡などにより戸籍から抜け、新しい戸籍が編成された場合、新しい戸籍には子供は記載されません。

上記のような出来事があり、子供が除籍された場合、戸籍が新しく作られるまでは、戸籍に子供は記載されますが、親が戸籍を転籍するなど戸籍が新しくなった場合、新しい戸籍には除籍された子供は記載されなくなります。

今回の場合、全戸主の「亡父」から、「亡父」の長男が新たに戸主になったので、新しく作られた戸籍には、長女と次女の情報は掲載されなかったのだと思います。今回の戸籍の前に作られた古い戸籍を入手できれば、そこには、長女と次女の情報が記載されていると思います。